Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLIN3O60664 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLIN3O60664 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms