Protein–RNA interactions for Protein: O60462

NRP2, Neuropilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRP2O60462 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRP2O60462 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRP2O60462 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms