Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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