Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms