Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNMO15061 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYNMO15061 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYNMO15061 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNMO15061 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms