Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EBAG9O00559 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms