Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRPO00253 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRPO00253 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRPO00253 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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