Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E9PBE3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E9PBE3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E9PBE3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E9PBE3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E9PBE3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E9PBE3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E9PBE3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E9PBE3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms