Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf58C9J3I9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms