Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf172C9J069 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms