Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4E171 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4E171 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4E171 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms