Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DGG1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DGG1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DGG1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DGG1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DGG1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DGG1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms