Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms