Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRR3A8MPY1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms