Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL13PA6NNM8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms