Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A6NL46 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms