Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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