Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms