Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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KCNIP3Q9Y2W7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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