Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms