Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms