Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms