Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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