Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RABGEF1Q9UJ41 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RABGEF1Q9UJ41 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RABGEF1Q9UJ41 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1Q9UJ41 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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