Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms