Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT172Q9UG01 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT172Q9UG01 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms