Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPB1Q9UBR1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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