Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CC2D2AQ9P2K1 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms