Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms