Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms