Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms