Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCM2LQ9NUG4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms