Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC22A11Q9NSA0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms