Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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LHX9Q9NQ69 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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LHX9Q9NQ69 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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