Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM15Q9C019 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms