Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms