Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP2Q9BX26 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms