Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK19Q9BWU1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK19Q9BWU1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms