Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMM29Q9BSF4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms