Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MESP1Q9BRJ9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms