Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms