Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCT8L2Q96SF2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms