Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms