Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85AQ96PX6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC85AQ96PX6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC85AQ96PX6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85AQ96PX6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms