Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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