Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms