Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms