Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms