Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms