Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HGDQ93099 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HGDQ93099 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HGDQ93099 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms